Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE4BO95155 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms