Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RHOBTB3O94955 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOBTB3O94955 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms