Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL18O94889 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL18O94889 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms