Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CIAO1O76071 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms