Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN15O75808 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN15O75808 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN15O75808 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms