Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA4O75335 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms