Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF3O75054 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms