Protein–RNA interactions for Protein: O60882

MMP20, Matrix metalloproteinase-20, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP20O60882 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP20O60882 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP20O60882 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP20O60882 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP20O60882 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP20O60882 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP20O60882 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP20O60882 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP20O60882 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP20O60882 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP20O60882 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP20O60882 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP20O60882 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP20O60882 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP20O60882 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP20O60882 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP20O60882 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP20O60882 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP20O60882 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP20O60882 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP20O60882 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP20O60882 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP20O60882 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP20O60882 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP20O60882 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP20O60882 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP20O60882 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP20O60882 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP20O60882 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP20O60882 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP20O60882 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP20O60882 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP20O60882 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP20O60882 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP20O60882 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP20O60882 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP20O60882 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP20O60882 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP20O60882 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP20O60882 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP20O60882 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP20O60882 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP20O60882 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP20O60882 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP20O60882 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP20O60882 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP20O60882 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP20O60882 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP20O60882 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP20O60882 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP20O60882 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP20O60882 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP20O60882 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP20O60882 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP20O60882 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP20O60882 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP20O60882 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP20O60882 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP20O60882 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP20O60882 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP20O60882 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms