Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms