Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA3O60609 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms