Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEMFO60524 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEMFO60524 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEMFO60524 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEMFO60524 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEMFO60524 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEMFO60524 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEMFO60524 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMFO60524 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMFO60524 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMFO60524 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMFO60524 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMFO60524 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMFO60524 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMFO60524 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMFO60524 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMFO60524 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMFO60524 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMFO60524 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEMFO60524 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEMFO60524 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEMFO60524 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEMFO60524 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEMFO60524 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEMFO60524 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEMFO60524 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEMFO60524 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEMFO60524 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEMFO60524 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEMFO60524 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEMFO60524 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEMFO60524 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEMFO60524 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEMFO60524 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEMFO60524 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEMFO60524 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEMFO60524 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEMFO60524 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NEMFO60524 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEMFO60524 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEMFO60524 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEMFO60524 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEMFO60524 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEMFO60524 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEMFO60524 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEMFO60524 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEMFO60524 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEMFO60524 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEMFO60524 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEMFO60524 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NEMFO60524 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEMFO60524 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEMFO60524 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEMFO60524 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEMFO60524 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEMFO60524 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NEMFO60524 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEMFO60524 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEMFO60524 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEMFO60524 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEMFO60524 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEMFO60524 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEMFO60524 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEMFO60524 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEMFO60524 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEMFO60524 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEMFO60524 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMFO60524 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMFO60524 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMFO60524 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMFO60524 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMFO60524 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMFO60524 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMFO60524 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMFO60524 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEMFO60524 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEMFO60524 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEMFO60524 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEMFO60524 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEMFO60524 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEMFO60524 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEMFO60524 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEMFO60524 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEMFO60524 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEMFO60524 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms