Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PPLO60437 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PPLO60437 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PPLO60437 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PPLO60437 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PPLO60437 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PPLO60437 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PPLO60437 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PPLO60437 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PPLO60437 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PPLO60437 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PPLO60437 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PPLO60437 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
PPLO60437 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PPLO60437 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PPLO60437 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PPLO60437 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PPLO60437 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PPLO60437 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PPLO60437 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PPLO60437 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PPLO60437 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PPLO60437 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PPLO60437 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PPLO60437 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PPLO60437 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PPLO60437 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PPLO60437 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PPLO60437 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PPLO60437 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PPLO60437 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PPLO60437 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PPLO60437 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PPLO60437 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PPLO60437 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PPLO60437 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PPLO60437 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PPLO60437 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PPLO60437 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PPLO60437 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PPLO60437 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PPLO60437 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PPLO60437 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PPLO60437 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PPLO60437 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPLO60437 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPLO60437 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PPLO60437 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPLO60437 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPLO60437 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPLO60437 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PPLO60437 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPLO60437 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPLO60437 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPLO60437 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPLO60437 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PPLO60437 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PPLO60437 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PPLO60437 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PPLO60437 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PPLO60437 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PPLO60437 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PPLO60437 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PPLO60437 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PPLO60437 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PPLO60437 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PPLO60437 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PPLO60437 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PPLO60437 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PPLO60437 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PPLO60437 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PPLO60437 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PPLO60437 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PPLO60437 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PPLO60437 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PPLO60437 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PPLO60437 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PPLO60437 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PPLO60437 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PPLO60437 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PPLO60437 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PPLO60437 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PPLO60437 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PPLO60437 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PPLO60437 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PPLO60437 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PPLO60437 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PPLO60437 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms