Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG3O60359 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG3O60359 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms