Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5O60239 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms