Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDIL3O43854 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDIL3O43854 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms