Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYTH3O43739 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH3O43739 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms