Protein–RNA interactions for Protein: O43612

HCRT, Orexin, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCRTO43612 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCRTO43612 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCRTO43612 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HCRTO43612 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCRTO43612 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCRTO43612 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCRTO43612 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCRTO43612 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCRTO43612 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCRTO43612 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCRTO43612 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCRTO43612 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCRTO43612 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCRTO43612 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCRTO43612 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCRTO43612 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCRTO43612 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCRTO43612 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCRTO43612 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HCRTO43612 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCRTO43612 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTO43612 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTO43612 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTO43612 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTO43612 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTO43612 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTO43612 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCRTO43612 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCRTO43612 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCRTO43612 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HCRTO43612 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCRTO43612 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTO43612 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTO43612 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTO43612 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTO43612 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTO43612 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTO43612 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCRTO43612 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCRTO43612 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTO43612 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTO43612 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTO43612 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTO43612 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTO43612 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTO43612 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTO43612 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCRTO43612 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCRTO43612 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCRTO43612 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCRTO43612 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCRTO43612 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCRTO43612 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCRTO43612 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCRTO43612 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCRTO43612 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCRTO43612 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCRTO43612 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HCRTO43612 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCRTO43612 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCRTO43612 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCRTO43612 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCRTO43612 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCRTO43612 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HCRTO43612 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HCRTO43612 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HCRTO43612 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HCRTO43612 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCRTO43612 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCRTO43612 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCRTO43612 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCRTO43612 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCRTO43612 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCRTO43612 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms