Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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NDUFS4O43181 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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NDUFS4O43181 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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NDUFS4O43181 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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NDUFS4O43181 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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NDUFS4O43181 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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NDUFS4O43181 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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NDUFS4O43181 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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NDUFS4O43181 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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NDUFS4O43181 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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NDUFS4O43181 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFS4O43181 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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