Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC4O15439 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC4O15439 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC4O15439 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC4O15439 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC4O15439 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC4O15439 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC4O15439 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms