Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GNPATO15228 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GNPATO15228 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GNPATO15228 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GNPATO15228 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GNPATO15228 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GNPATO15228 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNPATO15228 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNPATO15228 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNPATO15228 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNPATO15228 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNPATO15228 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNPATO15228 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNPATO15228 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPATO15228 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GNPATO15228 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GNPATO15228 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GNPATO15228 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GNPATO15228 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GNPATO15228 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GNPATO15228 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GNPATO15228 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GNPATO15228 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GNPATO15228 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GNPATO15228 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GNPATO15228 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GNPATO15228 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GNPATO15228 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPATO15228 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPATO15228 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPATO15228 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPATO15228 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPATO15228 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPATO15228 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPATO15228 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPATO15228 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPATO15228 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPATO15228 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPATO15228 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPATO15228 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPATO15228 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GNPATO15228 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GNPATO15228 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GNPATO15228 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPATO15228 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPATO15228 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPATO15228 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPATO15228 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPATO15228 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPATO15228 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPATO15228 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPATO15228 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPATO15228 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPATO15228 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPATO15228 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNPATO15228 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNPATO15228 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNPATO15228 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNPATO15228 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNPATO15228 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNPATO15228 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms