Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms