Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN9O14815 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms