Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHOX2AO14813 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHOX2AO14813 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms