Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A3R1O14745 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A3R1O14745 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3R1O14745 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3R1O14745 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3R1O14745 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3R1O14745 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3R1O14745 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3R1O14745 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3R1O14745 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3R1O14745 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3R1O14745 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3R1O14745 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3R1O14745 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms