Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPEO14579 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPEO14579 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPEO14579 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPEO14579 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPEO14579 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPEO14579 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPEO14579 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPEO14579 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPEO14579 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPEO14579 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPEO14579 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPEO14579 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPEO14579 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPEO14579 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPEO14579 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPEO14579 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPEO14579 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPEO14579 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPEO14579 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPEO14579 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPEO14579 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPEO14579 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPEO14579 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPEO14579 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPEO14579 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPEO14579 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPEO14579 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPEO14579 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPEO14579 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPEO14579 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPEO14579 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COPEO14579 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPEO14579 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPEO14579 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPEO14579 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPEO14579 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPEO14579 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPEO14579 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPEO14579 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPEO14579 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPEO14579 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPEO14579 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPEO14579 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPEO14579 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPEO14579 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPEO14579 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPEO14579 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPEO14579 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPEO14579 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPEO14579 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPEO14579 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPEO14579 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPEO14579 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COPEO14579 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPEO14579 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COPEO14579 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPEO14579 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPEO14579 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPEO14579 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPEO14579 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPEO14579 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPEO14579 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPEO14579 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPEO14579 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPEO14579 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPEO14579 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPEO14579 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPEO14579 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPEO14579 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPEO14579 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPEO14579 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPEO14579 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPEO14579 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPEO14579 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPEO14579 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPEO14579 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPEO14579 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPEO14579 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPEO14579 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms