Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXLO00592 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXLO00592 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXLO00592 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXLO00592 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXLO00592 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXLO00592 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXLO00592 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PODXLO00592 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PODXLO00592 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXLO00592 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXLO00592 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXLO00592 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXLO00592 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXLO00592 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXLO00592 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXLO00592 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXLO00592 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PODXLO00592 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXLO00592 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXLO00592 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXLO00592 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXLO00592 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXLO00592 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXLO00592 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PODXLO00592 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PODXLO00592 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXLO00592 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXLO00592 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXLO00592 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXLO00592 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PODXLO00592 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXLO00592 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXLO00592 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXLO00592 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXLO00592 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXLO00592 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXLO00592 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXLO00592 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PODXLO00592 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXLO00592 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXLO00592 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXLO00592 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXLO00592 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXLO00592 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXLO00592 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXLO00592 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXLO00592 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXLO00592 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PODXLO00592 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXLO00592 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXLO00592 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXLO00592 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXLO00592 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXLO00592 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXLO00592 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXLO00592 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PODXLO00592 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXLO00592 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXLO00592 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXLO00592 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXLO00592 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXLO00592 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXLO00592 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXLO00592 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PODXLO00592 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXLO00592 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXLO00592 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXLO00592 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXLO00592 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXLO00592 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXLO00592 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXLO00592 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms