Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KPNA3O00505 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms