Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC7O00311 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC7O00311 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC7O00311 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC7O00311 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC7O00311 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC7O00311 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC7O00311 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC7O00311 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC7O00311 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC7O00311 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC7O00311 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC7O00311 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC7O00311 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC7O00311 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC7O00311 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC7O00311 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC7O00311 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC7O00311 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC7O00311 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC7O00311 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC7O00311 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC7O00311 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC7O00311 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC7O00311 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC7O00311 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC7O00311 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC7O00311 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC7O00311 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC7O00311 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC7O00311 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC7O00311 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC7O00311 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC7O00311 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC7O00311 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC7O00311 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC7O00311 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC7O00311 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC7O00311 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC7O00311 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC7O00311 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC7O00311 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC7O00311 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC7O00311 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC7O00311 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC7O00311 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC7O00311 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC7O00311 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC7O00311 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC7O00311 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC7O00311 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC7O00311 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC7O00311 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC7O00311 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC7O00311 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC7O00311 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC7O00311 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC7O00311 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC7O00311 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC7O00311 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC7O00311 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC7O00311 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC7O00311 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC7O00311 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC7O00311 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC7O00311 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC7O00311 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC7O00311 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC7O00311 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC7O00311 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC7O00311 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC7O00311 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC7O00311 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC7O00311 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC7O00311 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC7O00311 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms