Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGRPO00253 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGRPO00253 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGRPO00253 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGRPO00253 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGRPO00253 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGRPO00253 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGRPO00253 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGRPO00253 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGRPO00253 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGRPO00253 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGRPO00253 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGRPO00253 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGRPO00253 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGRPO00253 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGRPO00253 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGRPO00253 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGRPO00253 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AGRPO00253 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGRPO00253 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AGRPO00253 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGRPO00253 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGRPO00253 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGRPO00253 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGRPO00253 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGRPO00253 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGRPO00253 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGRPO00253 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AGRPO00253 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGRPO00253 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGRPO00253 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGRPO00253 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGRPO00253 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGRPO00253 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGRPO00253 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AGRPO00253 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGRPO00253 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AGRPO00253 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGRPO00253 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGRPO00253 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGRPO00253 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGRPO00253 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGRPO00253 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGRPO00253 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGRPO00253 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGRPO00253 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGRPO00253 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGRPO00253 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGRPO00253 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGRPO00253 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGRPO00253 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGRPO00253 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGRPO00253 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGRPO00253 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGRPO00253 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGRPO00253 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AGRPO00253 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AGRPO00253 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGRPO00253 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGRPO00253 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGRPO00253 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGRPO00253 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGRPO00253 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGRPO00253 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGRPO00253 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AGRPO00253 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGRPO00253 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AGRPO00253 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGRPO00253 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGRPO00253 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGRPO00253 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGRPO00253 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGRPO00253 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGRPO00253 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGRPO00253 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGRPO00253 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGRPO00253 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGRPO00253 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGRPO00253 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGRPO00253 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGRPO00253 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGRPO00253 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGRPO00253 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGRPO00253 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGRPO00253 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGRPO00253 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGRPO00253 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGRPO00253 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGRPO00253 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGRPO00253 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGRPO00253 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGRPO00253 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGRPO00253 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGRPO00253 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGRPO00253 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGRPO00253 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGRPO00253 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGRPO00253 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGRPO00253 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AGRPO00253 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms