Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QKU1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QKU1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QKU1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QKU1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QKU1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QKU1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QKU1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QKU1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QKU1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QKU1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QKU1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QKU1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QKU1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QKU1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QKU1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QKU1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QKU1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QKU1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QKU1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QKU1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QKU1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QKU1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QKU1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QKU1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QKU1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QKU1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QKU1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QKU1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QKU1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QKU1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QKU1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QKU1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QKU1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QKU1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QKU1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QKU1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QKU1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QKU1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QKU1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QKU1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QKU1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QKU1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QKU1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QKU1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QKU1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QKU1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QKU1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QKU1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QKU1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QKU1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QKU1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QKU1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QKU1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QKU1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QKU1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QKU1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QKU1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QKU1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QKU1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QKU1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QKU1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3QKU1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3QKU1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QKU1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QKU1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QKU1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QKU1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QKU1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QKU1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QKU1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QKU1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QKU1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QKU1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QKU1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QKU1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QKU1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QKU1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QKU1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QKU1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QKU1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QKU1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QKU1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QKU1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QKU1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms