Protein–RNA interactions for Protein: H3BMM5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMM5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BMM5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BMM5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BMM5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BMM5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BMM5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BMM5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BMM5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BMM5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BMM5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BMM5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BMM5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BMM5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BMM5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BMM5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BMM5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BMM5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BMM5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BMM5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BMM5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BMM5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BMM5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BMM5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BMM5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BMM5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BMM5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BMM5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BMM5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BMM5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BMM5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BMM5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BMM5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BMM5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BMM5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BMM5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BMM5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BMM5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BMM5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BMM5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BMM5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BMM5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BMM5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BMM5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BMM5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BMM5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BMM5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BMM5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BMM5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BMM5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BMM5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BMM5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BMM5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BMM5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BMM5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BMM5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BMM5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BMM5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BMM5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BMM5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BMM5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMM5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BMM5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BMM5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BMM5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BMM5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BMM5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BMM5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms