Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf58C9J3I9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf58C9J3I9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C5orf58C9J3I9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C5orf58C9J3I9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C5orf58C9J3I9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf58C9J3I9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf58C9J3I9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms