Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERVV-2B6SEH9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVV-2B6SEH9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms