Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms