Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms