Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM3A6NNA2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRRM3A6NNA2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms