Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms