Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms