Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIPSLA2A3N6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms