Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CLRN2A0PK11 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLRN2A0PK11 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLRN2A0PK11 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLRN2A0PK11 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLRN2A0PK11 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLRN2A0PK11 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLRN2A0PK11 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLRN2A0PK11 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLRN2A0PK11 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLRN2A0PK11 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLRN2A0PK11 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms