Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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