Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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