Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXY3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXY3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0J9YXY3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms