Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SF12

CCDC163, Coiled-coil domain-containing 163, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC163A0A0D9SF12 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC163A0A0D9SF12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC163A0A0D9SF12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms