Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms