Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms