Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms