Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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ZNF346Q9UL40 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ZNF346Q9UL40 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ZNF346Q9UL40 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ZNF346Q9UL40 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF346Q9UL40 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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