Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms