Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms